Na het onderzoek start de behandeling. Deze afspraken duren max. 25 minuten en voor de behandeling van stotteren is dit max. 50 minuten. De behandelingen vinden in de meeste gevallen wekelijks plaats. De duur van de gehele behandelperiode varieert sterk en is afhankelijk van de ernst en de aard van het probleem en de motivatie/inzet van de patiënt. In principe zijn ouders aanwezig tijdens de behandeling.
De behandelingen vinden plaats in de praktijk tenzij dit op medische indicatie niet mogelijk is. In dat geval wordt de behandeling aan huis gegeven. Logopedie is een oefentherapie. Dat wil zeggen dat het essentieel is dat de aangeleerde oefeningen thuis (het liefst dagelijks!) herhaald worden.